БІОІНФОРМАТИЧНИЙ АНАЛІЗ ГЕНІВ sHSP У AMBORELLA TRICHOPODA ТА ORYZA SATIVA

Abstract

У геномі A. trichopoda є 24 гени sHSP, тоді як у O. sativa - 35. Довжина, молекулярна маса та розташування їхніх білків у клітині відрізняються. Хоча обидві родини sHSP розділені на структурні класи, амборелла має сім класів, а рис - вісім. Всі білки мають консервативний α-кристалічний домен, але існує багато варіацій у N- та С-кінцевих ділянках. Згідно з філогенетичним аналізом, кожен вид має як унікальні, так і спільні білки, що свідчить про втрату окремих генів і розширення еволюційних процесів. Різні види мають різну екзон-інтронну структуру генів, причому одноінтронні гени є більш поширеними. Порівняно з амбореллою, рис мав більш рівномірний, але нерівномірний розподіл генів sHSP. Це свідчить про те, що родина має складну еволюційну історію, яка включає в себе адаптацію до стресу та відбір